Bioinformatiker till Klinisk Mikrobiologi

Vill du vara med och utveckla framtidens bioinformatiska verktyg för genomisk mikrobiologisk diagnostik? Har du erfarenhet av bioinformatik, programmering och ett intresse för forskning och samarbete i en högteknologisk miljö? Då kan du vara den vi söker till Klinisk mikrobiologi vid Karolinska Universitetssjukhuset!

Du erbjuds

• möjlighet att arbeta med mikrobiologisk diagnostik av infektionssjukdomar
• samarbeta med Karolinska Institutet inom forskning och undervisning
• tillgång till specialanalyser och arbete med storskalig analysverksamhet med högteknologisk utrustning
• en chans att arbeta med teknik i framkant och bidra till forskning och utveckling
• aktivt deltagande i ett intensivt förändringsarbete inom ett område med snabb teknisk utveckling
• ett stimulerande arbete i en dynamisk och föränderlig verksamhet.    

Självklart får du också ta del av våra generella förmåner som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder dig.

Om tjänsten

Arbetet som bioinformatiker innebär att utforma och utveckla bioinformatiska verktyg för mikrobiologisk diagnostik och forskning, med fokus på helgenomsekvensering av mikroorganismer (bakterier, virus och svamp) samt mikrobiologisk metagenomik. Du kommer att arbeta med både utveckling och drift i nära samverkan med klinikanknutna bioinformatiker vid Karolinska Institutet och SciLifeLab samt klinikens molekylärbiologer, läkare och forskare.

Vi söker dig som

• är initiativrik och flexibel, med förmåga att anpassa dig till en dynamisk verksamhet inom bioinformatik och mikrobiologisk diagnostik
• kan arbeta och driva utvecklings- och driftprojekt självständigt samtidigt som du bidrar aktivt i gruppsamarbeten
• är analytisk och har en god förmåga att prioritera samt arbeta effektivt med komplexa data och verktyg
• arbetar strukturerat och resultatinriktat, med fokus på att utveckla och optimera bioinformatiska lösningar
• har mycket god samarbetsförmåga och trivs med nära samarbete med forskare, kliniker och experter inom olika discipliner.

Kvalifikationer

Krav:

• Magisterexamen inom data- eller livsvetenskaper från högskola eller universitet
• Utmärkta kunskaper i bioinformatik inom genomik och NGS
• Mycket goda programmeringskunskaper i Python och erfarenhet av att arbeta i Linux-miljö
• Goda kunskaper i svenska i tal och skrift

Meriterande:

• Disputerad inom bioinformatik, bioteknologi eller annat relevant ämnesområde
• Erfarenhet av arbete med mikrobiella frågeställningar
• Erfarenhet av arbete med system för versionskontroll (exempelvis git)
• Erfarenhet av arbete i Nextflow
• Erfarenhet av arbete med container-teknologier såsom Docker, Singularity eller Podman

Om rekryteringsprocessen

Urval och intervjuer sker fortlöpande under ansökningstiden och tjänsten kan komma att tillsättas innan sista ansökningsdag.

Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!