Bioinformatiker till Karolinska Universitetssjukhuset - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK) vid Karolinska Universitetssjukhuset söker tre bioinformatiker för att stärka den pågående implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom den molekylära diagnostiken.

Om oss
GMCK är en strategisk, långsiktig satsning med syfte att underlätta introduktion av högspecialiserad diagnostik inom universitetssjukvården och därmed bidra till den pågående implementeringen av precisionsmedicin. GMCK verkar i nära samarbete med flera funktionsområden inom Medicinsk Diagnostik Karolinska samt nyligen inrättade Precisionsmedicinskt Centrum Karolinska (PMCK).

Om tjänsten
I rollen som bioinformatiker utförs arbetet i nära samarbete med Karolinska Institutet representerat av enheten Clinical Genomics vid Science for Life laboratoriet (SciLifeLab). Du arbetar i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, sjukhusgenetiker, molekylärbiologer, andra bioinformatiker och mjukvaruutvecklare inom sjukhuset samt på Clinical Genomics på SciLifeLab. 

Arbetsuppgifterna anpassas individuellt och inkluderar bland annat:

• Utveckling av bioinformatiska analysflöden för olika diagnosområden.
• Utvärdering av nya analysverktyg.
• Deltagande i analys av patientprover i klinisk rutin samt delta i flera pågående F&U och kliniska implementationsprojekt.
• Att i samarbete med systemutvecklare samt externa samarbetspartners delta i koordinering och utveckling av informatiklösningar för klinisk tolkning av genomik och transkriptomikdata.
• Deltagande i flera nationella och internationella samarbeten, exempelvis Genomic Medicine Sweden.

Vi söker
Vi söker dig som är självständig, ambitiös och initiativtagande, men som samtidigt uppskattar arbete i grupp för att nå gemensamma mål. Du har god samarbetsförmåga och har lätt för att bygga relationer med olika personalgrupper. Denna roll kräver att du är strukturerad med mycket god teknisk förståelse för bioinformatik inom genomik.

Ta chansen och sök tjänsten om du vill ha ett spännande arbete och möjlighet att arbeta multidisciplinärt i diagnostikens framkant!

Kvalifikationer
Krav:

• Examen inom data eller livsvetenskaper från högskola eller universitet.
• Erfarenhet av bioinformatik eller utveckling av bioinformatiska analysflöden inom området storskalig DNA sekvensering (NGS).
• Utmärkta programmeringskunskaper i Python.
• Erfarenhet av arbete med system för versionskontroll (git).
• Goda kunskaper i Linux.
• Mycket goda kunskaper i engelska.

Meriterande:

• Disputerad inom bioinformatik, bioteknologi, medicin eller motsvarande.
• Erfarenhet av utveckling i nextflow eller snakemake.
• Erfarenhet av arbete med Docker, Singularity, Podman eller Kubernetes teknologier.
• Erfarenhet av att leverera strukturerad kod automatiserade tester samt CI.

För att din ansökan ska vara komplett ska den innehålla:
1. CV
2. Personligt brev
3. Övriga bilagor

Varmt välkommen med din ansökan!