Bioinformatiker inom long-read sekvensering till Genomic Medicine Center Karolinska

Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), en del av funktionen Medicinsk Diagnostik Karolinska (MDK), söker nu bioinformatiker för att stärka den pågående implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom den molekylära diagnostiken. Kom och arbeta hos oss med den senaste tekniken på ett av världens mest avancerade sjukhus!

Du erbjuds

• en spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter
• stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta an nya arbetsuppgifter över tid
• möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant (länk till newsweek: World's Best Hospitals 2025 - Newsweek Rankings).

Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset får du självklart också ta del av de förmåner som vi erbjuder!

Om tjänsten

Du arbetar i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, molekylärbiologer, andra bioinformatiker och mjukvaruutvecklare inom sjukhuset samt med forskningsinfrastrukturen Clinical Genomics vid Science for Life laboratoriet (SciLifeLab) och forskargrupper på Karolinska Institutet. Vi använder de senaste teknikerna för storskalig DNA sekvensering och skapar ett stort värde för patienterna genom att hjälpa till att ställa exakt molekylär diagnos.

Du kommer arbete i vårt arbetsflöde för sällsynta diagnoser med införande av long-read sekvensering i klinisk rutin. Arbetsuppgifterna består huvudsakligen i att utveckla den bioinformatiska analysprocessen samt att bidra till att tolka data. Det ingår även arbete med att utvärdera nya analysstrategier och tekniska lösningar kan ingå i arbetsuppgifterna. 

Vi söker dig som

• är självgående och stabil, men som samtidigt uppskattar arbete i grupp för att nå gemensamma mål
• har god samarbetsförmåga och har lätt för att bygga relationer med olika personalgrupper
• är strukturerad med god teknisk förståelse för bioinformatik inom genomik
• är serviceinriktad och kvalitetsmedveten, då arbetet innebär analys av patientprover åt medicinska enheter på funktionen Medicinsk Diagnostik Karolinska.

Kvalifikationer

Krav:

• Magister eller ingenjörsexamen inom data eller livsvetenskaper från högskola eller universitet
• Erfarenhet av analys och tolkning av long-read sekvenseringsdata för kliniska applikationer (diagnostiska analyser) inom sällsynta sjukdomar eller cancer.
• Erfarenhet av programmering i Nextflow
• Programmeringskunskaper i Python och R.
• Erfarenhet av arbete i Linux/Unix miljö

Meriterande:

• Erfarenhet  utveckling av bioinformatiska analysflöden inom området storskalig DNA sekvensering med Illumina sekvenseringsteknologi.
• Erfarenhet av arbete i en kvalitetssäkrad laboratoriemiljö (ISO/IEC 17025 eller ISO/IEC 15189).

Om rekryteringsprocessen

Urval och intervjuer kommer att ske löpande. 

Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!