Bioinformatiker till GMCK på Karolinska Universitetssjukhuset

Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), en del av funktionen Medicinsk Diagnostik Karolinska (MDK), söker nu två bioinformatiker för att stärka den pågående implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom den molekylära diagnostiken. Kom och arbeta hos oss med den senaste tekniken på ett av världens mest avancerade sjukhus!

Du erbjuds

• en spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter
• Stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta an nya arbetsuppgifter över tid.
• möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant (länk till newsweek: World's Best Hospitals 2024 - Newsweek Rankings)

Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset får du självklart också ta del av de förmåner som vi erbjuder!

Om tjänsten

Du arbetar i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, molekylärbiologer, andra bioinformatiker och mjukvaruutvecklare inom sjukhuset samt med forskningsinfrastrukturen Clinical Genomics vid Science for Life laboratoriet (SciLifeLab) och forskargrupper på Karolinska Instiutet. Vi använder de senaste teknikerna för storskalig DNA sekvensering och skapar ett stort värde för patienterna genom att hjälpa till att ställa exakt molekylär diagnos.

Arbetsuppgifterna består huvudsakligen av att delta i arbetet med tolkning av sekvenseringsdata inom cancer (solida tumörer), förbereda underlag till utsvar och kommunicera resultat till molekylärpatologer och övriga vårdaktörer.

Övriga arbetsuppgifter kan bestå av vidareutveckling av bioinformatiska analysflöden, utvärdering av nya analysverktyg, deltagande i nationella och internationella samarbeten, samt delta i vetenskapligt arbete. Arbetsuppgifterna anpassas utifrån kompetens och intressen.

Kvalifikationer

Krav:

• Magister eller ingenjörsexamen inom data eller livsvetenskaper från högskola eller universitet.
• Erfarenhet av analys av short-read sekvenseringsdata för kliniska applikationer inom områden cancer eller genetiska sjukdomar.
• Programmeringskunskaper i Python och R.
• Erfarenhet av arbete i Linux/Unix miljö.

Meriterande:

• Erfarenhet utveckling av bioinformatiska analysflöden inom området storskalig DNA sekvensering.
• Erfarenhet av analys av Illumina sekvenseringsdata.
• Erfarenhet av arbete med system för versionskontroll (git).
• Erfarenhet av arbete i en kvalitetssäkrad laboratoriemiljö (ISO/IEC 17025 eller ISO/IEC 15189).
• Disputerad inom relevant ämnesområde

Vi söker dig som

• är självgående och stabil, men som samtidigt uppskattar arbete i grupp för att nå gemensamma mål
• har god samarbetsförmåga och har lätt för att bygga relationer med olika personalgrupper
• är strukturerad med god teknisk förståelse för bioinformatik inom genomik
• är serviceinriktad och kvalitetsmedveten, då arbetet innebär analys av patientprover åt medicinska enheter på funktionen Medicinsk Diagnostik Karolinska

Om rekryteringsprocessen

Urval och intervjuer kommer att ske fortlöpande. Tjänsten kan komma att tillsättas innan sista annonseringsdatum, vänta därför inte med att skicka in din ansökan!

Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!